Într-un interviu acordat jurnalistei Kseniei Sobciak de la postul de televiziune ”Dojd” (Ploaia) din Federația Rusă, fostul opozant a declarat că „Transnistria” este de facto și rămâne a fi un stat independent în raport cu Republica Moldova și că este necesar ca Federația Rusă să recunoască independența „Transnistriei”, exact așa cum a recunoscut, în 2008, independența Abhaziei și Oseției de Sud, transmite Romanian Global News.
”Nu putem compara Crimeea cu Abhazia. În Abhazia a avut loc un conflict militar și aceasta este deja de mulți ani un stat independent. Acest fapt nu poate fi nicidecum comparat cu Transnistria, care, de facto, este deja de mulți ani un stat independent de Republica Moldova”, a subliniat Navalnyi miercuri, 7 iunie 2017. Potrivit acestuia, el s-a pronunțat încă din anul 2008 pentru recunoașterea independenței Transnistriei de către Moscova, aceasta fiind poziția oficială a mișcării sale politice.
Declarațiile lui Navalnyi despre necesitatea recunoașterii independenței Transnistriei au fost făcute în cadrul discuției despre anexarea Crimeii, Navalnyi considerând că următorul președinte al Federației Ruse va trebui să desfășoare în Crimeea un nou referendum ”normal și corect”, astfel încât anexarea să nu fie pusă la îndoială de către partenerii externi ai Moscovei.
Din perspectiva legislației în Republica Moldova cu privire la separatism, afirmațiile lui Navalnyi ar fi putut face obiectul unei cauze judiciare în care acesta să fie condamnat la ani grei de închisoare în Republica Moldova.